眾所周知，慈禧的墓是被東陵大盜孫殿英挖掘的。1928年，孫殿英投靠蔣介石不久，奉命率領部隊駐扎在河北薊縣一帶清除盜匪，當時土匪馬福田正準備盜取清東陵，孫殿英得知以后，打著軍事演習的幌子，將馬福田趕走，以雷厲風行之勢變兵為匪，展開了對清東陵的瘋狂猖獗的盜掘。

所有的金銀財寶用了20輛大車才拉走，清東陵遭到了嚴重破壞，就這一點，孫殿英無異于民族罪人。兵痞們在瘋狂掠奪慈禧棺木內的珠寶時，慈禧的身體也遭到了破壞，以至于上身赤裸。

1984年的時候，我國的國家文物局曾經對清東陵慈禧太后的陵墓進行了清理。打開慈禧棺木后，科學家們看到，慈禧的遺骸頭朝北、腳朝南，呈仰臥的姿勢，腦袋稍微偏左了一些。慈禧上身赤裸，下身穿著褲子，僅剩的皮囊貼在骨頭上。在慈禧的遺骸上，還蓋著一件黃綢被，一件黃袍，還有一件馬褂。在她的身邊還遺留了一個黃綢包袱，里面有牙齒、指甲等物。

溥儀后來知道了東陵被盜挖的事情，他此時已被趕出了紫禁城，不過畢竟自家祖墳被盜挖了，聞訊如遭五雷轟頂。善后人員打開了慈禧陵墓后，發現陵墓內一片狼藉，衣服被褥被扔的到處都是。慈禧的遺體俯身臥在了棺蓋上，臉朝下，頭朝北，腳朝南，她的頭髮呈現青黑色，披散著，上身的衣服被扒光，皮肉緊貼在骨頭上。由于天氣炎熱，地宮內又很潮濕，慈禧的遺體發霉，長出了一寸左右的白毛，她的下面穿著褲子，一只腳赤裸，一只腳搭著襪子。

善后小組進行了較為簡單的善后，最終變成了1984年科學家看到的樣子。